Information

Vad är meningen med "Rb är i aktivt tillstånd"?

Vad är meningen med


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Jag läser om cykliner, cdks och Rb (Retinoblastom) och en del av terminologin är inte klar för mig.

Jag förstår att när CDK fosforylerar Rb, kopplas det från E2F, och E2F kan fungera som en transkriptionsfaktor. Min fråga handlar om terminologin.

Mina frågor är:

  1. När folk säger "Rb är aktivt", menar de "aktivt = fosforylerat tillstånd" (där E2F är fritt från Rb) eller menar de "aktivt = inte fosforylerat tillstånd"?

  2. Betyder "aktivt cyklin" att cyklin kommer att ansluta sig till CDK och cellcykeln fortsätter? eller är "aktivt cyklin = cyklin aktiverar inte CDK och cellcykeln pausad"?

  3. Aktiv CDK betyder att CDK aktiveras av cyklin och cellcykeln kan fortsätta?

Generellt kanske man kan säga att bindning (Rb med E2F eller Cyclin med CKD) betyder aktivering och frånkoppling betyder inaktivering?

Tack!

(Bildkälla: Kolch, Walter, et al. "The role of Raf kinases in malignant transformation." Expertrecensioner i molekylär medicin 4.8 (2002): 1-18.)


  1. Terminologin för "Rb är aktiv/inaktiv" hänvisar till aktiviteten att hämma E2F. Så aktiv Rb hämmar E2F, medan inaktiv Rb inte hämmar E2F.
    När det gäller Rb och fosforylering - historien verkar vara mer komplex ([1] beskriver Rb som en gåta).
    Enligt [2] (detta citat är från sammanfattningen av tidningen av eLife):

    Narasimha, Kaulich, Shapiro et al. presenterar nu biokemiska analyser av Rb-proteiner som visar - helt oväntat - att cyklin D-komplexet bara lägger till en fosfatgrupp till Rb under G1-fasen, även om denna grupp kan läggas till en av fjorton olika platser. De resulterande "monofosforylerade" Rb-varianterna kan var och en binda olika transkriptionsfaktorer och stoppa dem att fungera.
    Vid restriktionspunkten tillsätts sedan snabbt många fler fosfatgrupper, och Rb-proteinet inaktiveras av ett annat cyklin. Detta cyklin som kallas Cyclin E driver sedan celler in i nästa fas av cellcykeln. Att fastställa hur cyklin E aktiveras är en prioritet för framtida forskning.

  2. + 3. Wikipedias sida för cyklinberoende kinas (CDK) säger:

    Per definition binder en CDK ett regulatoriskt protein som kallas cyklin. Utan cyklin har CDK liten kinasaktivitet; endast cyklin-CDK-komplexet är ett aktivt kinas.

    Wikipedias sida för proteinkinas säger:

    Ett proteinkinas är ett kinasenzym som modifierar andra molekyler, mestadels proteiner, genom att kemiskt lägga till fosfatgrupper till dem (fosforylering).

    Och här är en trevlig visuell förklaring från Life: The Science of Biology (10:e upplagan):

    Så både "aktivt CDK" och "aktivt cyklin-CDK-komplex" (och enligt det andra svaret, även "aktivt cyklin") hänvisar till fallet där ett cyklin binds till en CDK för att bilda ett cyklin-CDK-komplex, t.ex. att CDK kan fosforylera något substrat.
    (Jag nämnde inte cellcykeln här med flit, eftersom jag inte är expert, och därför är jag försiktig med att hävda att en aktiv CDK alltid driver cellcykeln framåt. Om jag förstår det rätt vet vi fortfarande inte exakt hur varje cyklin-CDK-komplex påverkar cellcykeln.)


När det gäller din sista fråga:

Generellt kanske man kan säga att bindning (Rb med E2F eller Cyclin med CKD) betyder aktivering och frånkoppling betyder inaktivering?

Som nämnts ovan kan man säga det om en cyklin och dess CDK.
Tyvärr kan man inte säga det generellt. E2F här är ett motexempel (det inhiberas när Rb binder till det och aktiveras när Rb kopplas bort från det).
Men man kan säga att i allmänhet, när något binder till ett protein, kan proteinet ändra sin form, vilket kan leda till att någon funktion aktiveras eller hämmas.


[1] Dyson, Nicholas J. "RB1: en prototyp tumörsuppressor och en gåta." Gener & development 30.13 (2016): 1492-1502.

[2] Narasimha, Anil M., et al. "Cyclin D aktiverar Rb-tumörsuppressorn genom monofosforylering." Elife 3 (2014): e02872.


Rb: Den underfosforylerad, aktiv form av RB1 interagerar med E2F1 och undertrycker dess transkriptionsaktivitet, vilket leder till cellcykelstopp. (UniProt: P06400)

Cyclin-D: Regulatorisk komponent i cyklin D1-CDK4 (DC)-komplexet som fosforylerar och hämmar medlemmar av retinoblastom (RB) proteinfamiljen inklusive RB1 och reglerar cellcykeln under G1/S-övergången. (UniProt: P24385)

Aktivt cyklin-D (d.v.s. cyklin-D i komplex med CDK4) fosforylerar (d.v.s. inaktiverar) Rb.